Als een vogel ‘dik’ zit of een afwijkende ontlasting heeft, bijvoorbeeld gelig, dun en/of met onverteerde zaadjes, dan is het verstandig een mestonderzoek te laten doen. Zet de bewuste vogel(s) apart van de gezonde vogels en ontsmet in elk geval de kooi waarin de afwijking is geconstateerd.
Veel voorkomende ziekten bij vogels zijn: Coccidiose, atoxoplasmose, campylobacter en megabacter.
De eerste twee zijn besmettingen met eencellige organismen, z.g. protozoën.
Campylobacter is een bacterie en megabacter vermoedelijk een schimmel, ondanks dat de naam anders doet vermoeden. Bestrijding vindt plaats met medicijnen. Voor megabacter zijn intussen medicijnen op de markt op basis van in water oplosbare Amphoteracine-B.